Turistas videograbaron la presencia excesiva de ardillas en la pirámide de Cholula, lo que puede representar un daño a las estructuras de la zona arqueológica.
En el 2018 se advirtió del daño a las estructuras de la iglesia de Los Remedios que se encuentra arriba de la pirámide por las excavaciones que hacen las ardillas para hacer sus nidos.
Actualmente en la parte descubierta de la pirámide se pueden apreciar decenas de ardillas que han excavado en la zona arqueológica.
